Vĩnh Trường là một phường biển, nằm ở phía Đông Nam thành phố Nha Trang, có địa hình bán sơn địa, nằm trên bờ Bắc nhánh sông Cái đổ ra Cửa Bé - Bình Tân, đối diện bờ Nam là núi Hòn Rớ gắn với dãy Hoàng Ngưu chạy vào tới sông Lô - Cù Hin. Vĩnh Trường ngày nay có diện tích tự nhiên khoảng 1,85 km2, địa thế nhỏ hẹp, chiều dài khoảng 3km, bề ngang khoảng 700m. Phần lớn diện tích của Vĩnh Trường bằng phẳng, nhưng có thế tựa lưng núi Chụt và núi Hòn Rớ - Hoàng Ngưu, hướng ra biển lớn về phía Đông.
Về sông ngòi, Vĩnh Trường có con sông mà người dân thường gọi là sông Bình Tân hoặc sông Cửa Bé, nằm về phía Nam dọc chân núi Rớ - Hoàng Ngưu. Sông Cửa Bé là một nhánh của sông Cái Nha Trang, bắt nguồn từ hòn Gia Lê (Khánh Vĩnh), cao 1,812m chảy qua hai huyện Khánh Vĩnh Và Diên Khánh đến thành phố Nha Trang và đổ ra biển. Sông chảy đến địa phận thôn Xuân Lạc, xã Vĩnh Ngọc chia thành hai chi lưu. Trong đó, một chi lưu chảy men theo núi Đồng Bò đổ ra biển Cửa Bé lại là nơi hội tụ của 2 nhánh sông Quán Trường và sông Tắc, nhánh này hiện nay đã bị bồi lắng, chỉ đến mùa lũ chính mới hiện rõ.
Về khí hậu, là phường nội thành của thành phố Nha Trang, do đó về khí hậu, Vĩnh Trường có đặc điểm chung của khí hậu thành phố Nha Trang tỉnh Khánh Hòa đó là nền khí hậu cận xích đạo khô ráo, ôn hòa, nhiệt độ trung bình cao từ 26 – 280C, với 02 mùa mưa và mùa khô rõ rệt. Mùa mưa thường bắt đầu từ tháng 9 đến tháng 12 hàng năm, mùa khô kéo dài từ tháng 1 đến hết tháng 8. Tuy nhiên, phường Vĩnh Trường chịu tác động của khí hậu biển Đông nên có độ ẩm cao, mặn thuận lợi cho hoạt động ngư nghiệp đánh bắt, nuôi trồng thủy sản, hải sản và làm muối.
Về vị trí địa lý, Vĩnh Trường nằm ở hướng Đông Nam, thành phố Nha Trang, cách trung tâm thành phố khoản 4 km, tiếp giáp với khu căn cứ địa cách mạng Đồng Bò, có vị trí tứ cận như sau:
- Phía Bắc: Giáp phường Phước Long
- Phía Nam: Giáp với sông Tắc (Xã Phước Đồng)
- Phía Đông: Giáp với phường Vĩnh Nguyên.
- Phía Tây: Giáp với phường Phước Long.
Do có vị trí địa lý quan trọng nên trong 30 năm chiến tranh chống thực dân Pháp và đế quốc Mỹ xâm lược, Vĩnh Trường đã chịu hậu quả nặng nề của hai cuộc chiến tranh, đóng vai trò chiến lược là bàn đạp, vành đai bảo vệ và tiếp sức người, sức của cho khu căn cứ với phong trào cách mạng ở thị Nha Trang. Tong thời kỳ xây dựng và bảo vệ Tổ quốc từ sau giải phóng đến nay, Đảng bộ và nhân dân Vĩnh Trường luôn biết phát huy lợi thế về vị trí chiến lược của mình để xây dựng quê hương ngày càng giàu mạnh, công bằng, dân chủ, văn minh xứng đáng với truyền thống cách mạng của một vùng đất anh hùng.